烟叶被运出农场后，需要堆放发酵、拆堆通风，然后重新堆放醇化。醇化好的烟叶还需要回潮，并根据颜色手工分级。这又需要经过几十双手。此外，用作茄衣的烟叶还需要手工除梗，将粗大的叶脉抽出来，用作茄心的烟叶也需要除去部分烟梗，然后让剩余的部分保持完好无损。在卷制过程中，需要人来分发恰当比例的各种醇化烟叶，卷烟师把属于自己的一堆烟叶抱回自己的工作台卷制。卷制好的雪茄根据颜色手工分类，然后送进醇化室，最终被粘上腰花、装进盒子、运到店中。尽管并非所有的环节都是纯手工，但是一支手卷雪茄是群体努力的结晶，需要很多双手的参与。

发酵对于红酒和烈酒来说十分平常，这是一个将糖分转化为酒精的过程，通常需要使用酵母。对烟草来说，发酵更多的是一种微生物发酵，通过水分、压力和氧气的加入，将烟叶成分有机分解。在烟叶发酵过程中不产生酒精，但这一过程产生热量，改变烟叶的化学成分和物理性状。雪茄烟叶的发酵是非常简单的：一旦烟叶烘烤好，烟叶就被堆成大堆，唯一添加的是水，烟叶堆的重量产生压力，而酶和微生物的分解产生热量。当烟叶堆达到规定温度，就会被翻堆。发酵会使烟叶口味更好。这一过程影响烟叶的风味和香气，减少其刺激性，突显其花香、果香和甜味。烟叶的发酵时间因其大小和品种而有所不同，对于高端雪茄来说至关重要。

无论是卷制前，还是卷制后，醇化都在雪茄生产中扮演着关键角色。刚刚卷制好的雪茄会被送进醇化室。当一支雪茄达到其风味的巅峰状态时，这就实现了完美醇化。在这个时刻，雪茄的风味不仅处于最均衡、最稳定的状态，而且所有诸如苦味和粗糙感等人们所不希望保留的品质特点都没有了。当然，雪茄也不是醇化时间越长越好，因为，过长时间醇化的雪茄，会失掉风味，吸起来平淡寡味。另外，需要提醒的是，一支劣质雪茄无论醇化多长时间都不会使其变好，只会使其变得更差。